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在日本使用手机号注册微信号是不需要支付额外的费用的。与在国内注册微信账号一样，只需要下载微信应用，然后根据提示使用自己的手机号进行注册即可。

但请注意，如果在注册过程中有提示需要购买VIP或者支付其他费用才能享受全部功能，那可能是该应用内的一些增值服务，并不是注册费用，具体费用情况建议参考微信官方的最新政策及说明。